船只控制主要分为放置与航行两类操作。对于传信纸船类道具，需先在遇境魔法商船或暮土失落方舟消耗白蜡烛兑换道具，随后在开放水域激活。玩家需站立于有效水体中开启魔法列表，拖拽纸船图标至水面触发留言交互界面，字符上限为30个中文或英文单位，放置后持续48小时且同时存在上限为两艘。特殊环境如黑水区域需完全浸入水体并长按拖动图标直至系统提示，而冰面放置则依赖地形坡度调整角度以避免滑动。船体方向与位置在放置时便已固定，无法二次调整。
航行类船只多见于特定地图场景，如预言季试炼或双面湖区域。基础操控依赖左右手协同：左侧屏幕滑动控制转向，右侧滑动决定前进或后退动力。启动前需靠近码头触发交互按钮，初始建议在平静水域练习转向与急停。能量管理是长途航行的核心，需观察风道气流或发光生物位置补充动力，多人协作时可牵手由高能量玩家主导方向。部分船只如试炼洞穴的机关舟需先点燃环境光源，后用光球激活船体符号实现自动航行，此过程中需专注规避礁石障碍。
部分船只可通过特殊动作实现空间突破。双人协作时发起背背动作可使船体垂直上升，结合乐器演奏触发跟随功能可实现螺旋穿墙。单人玩家则利用地形弹射机制，在起跳瞬间切换飞行模式并下拉方向键产生爆发推力。无论何种上升方式，均需注意云层边界参照以避免突破地图限制，斗篷等级直接影响滞空续航，建议提前收集光之翼强化容量，途经蜡烛或光源及时补充能量。
暮土黑水区航行时抬升坐姿避免角色肢体接触腐蚀水体，并利用沉船残骸作掩体躲避冥龙。双面湖区域需观察黄昏时分的湖心漩涡动态，船只轨迹可能触发隐藏动画。冰面停泊需借助边缘凸起或障碍物稳定船身，节日限定冰湖会赋予船只特殊视觉效果但操控逻辑不变。航行中需持续收集场景光点补充能量，并留意环境变化触发的通道机制，如浮岛秘境的气流或遥鲲路径可辅助抵达高处。
空中转向需轻缓滑动屏幕避免角度突变导致的失控，俯冲操作通过向下滑动实现，攀升则需点击翅膀消耗能量并长按屏幕上划。滑翔模式适用于节能巡航，右侧按钮可快速切换飞行状态。多人协作若遇串线问题，可通过特殊符号断网后重连恢复。整个航行过程需保持耐心，逐步适应不同船体的物理反馈特性，方能高效探索隐藏区域。
